Christophe Slagmuylder a étudié l'histoire de l'art à l'Université libre de Bruxelles. En 2002, il devient membre de l'équipe de programmation du Kunstenfestivaldesarts de Bruxelles, festival d'art contemporain dans les domaines du théâtre, de la danse, de la performance et des arts visuels. En 2007, il en devient directeur artistique. En 2018, il devient directeur de la programmation du festival Theater der Welt 2020 à Düsseldorf, qui a lieu tous les trois ans dans des villes différentes. En juin 2018, il est nommé directeur du Festival de Vienne 2019, son contrat est prolongé par la suite jusqu'en 2024. En 2022, il est nommé directeur général de BOZAR, à Bruxelles.